南京天印山医院于2019年底立项建设，多次列入江苏省重大项目计划和南京市经济社会发展重大项目计划。2020年4月7日，正式开工和打下第一根支护桩；2021年6月25日，医院建筑主体结构封顶，转入内部装修阶段。2022年1月4日，获得江苏省卫健委 三级肿瘤医院 医疗机构设置批准；2022年2月15日，纳入《南京市 十四五 医疗机构设置规划》的 三级医院 目录。2023年10月底通过市、区政府有关部门组织的规划变更、竣工核查和消防验收，12月初通过省、市卫健委组织的医疗验收和现场检查，已经获得《医疗执业许可证》，12月22日开业运行。
医院参照国家级区域医疗中心和国际先进的综合肿瘤中心的标准进行建筑设计和施工建设，环境优美、设施先进、学科齐全、技术力量雄厚，将立足南京、辐射周边，面向全国，走向世界，成为集临床诊疗、医学教育与科技创新为一体的现代化高水平医院。
